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/etc/nginx/nginx.conf 用到
app.d → /var/tmp/nginx/app.d
conf.d → /usr/local/etc/nginx/conf.d
sites-enabled → /usr/local/etc/nginx/sites-enabled
進入 app.d 可以看到 server.webstation-vhost.conf 內的虛擬主機設定
裡面引用到 conf.d 下面的目錄。目錄裡面要加上設定檔（dokuwiki.conf），內容如下：

location ~ /(data|conf|bin|inc|vendor)/ {
    deny all;
}

另外 /etc/nginx/nginx.conf 內可看到 /.well-known/acme-challenge 的根目錄被連結到 /var/lib/letsencrypt 下，
請在 /var/lib/letsencrypt 目錄下建立 ln .well-known → /volume1/web/.well-known/

編輯完畢用 sudo nginx -t 測試，sudo nginx -s reload 重新載入。